Mikroorganismy nejsou viditelné pouhým okem, ale pouze pomocí mikroskopu. Patří mezi ně různé bakterie, plísně nebo kvasinky. Jejich studiem se zabývá obor mikrobiologie. Bakterie jsou jednobuněčné organismy převážně kokovitého nebo tyčinkovitého tvaru. Jejich studiem se zabývá obor bakteriologie. Velký zlom v léčbě bakteriálních infekcí nastal v roce 1928, když skotský lékař Alexander Fleming objevil penicilin. Antibiotika jsou látky, které brání růstu mikroorganismů nebo je rovnou usmrcují. Fenoménem dnešní doby je nadužívání antibiotik, v důsledku čehož se bakterie stávají vůči jejich účinkům resistentní. Antibakteriální účinky mají také některé přírodní látky, které nalezneme například v česneku nebo v šalvěji. Antibakteriální terapii se věnují například publikace Antibakteriální politika a prevence v nemocnici nebo Přírodní antibiotika.