Biotopem myslíme určité místo, ve kterém je díky různým vlivům vytvořeno přírodní prostředí, v němž se nacházejí určité organismy. V České republice se nachází více než 150 přírodních biotopů, patří k nim různé skály, vodní toky a nádrže, rašeliniště, jeskyně, vřesoviště, lesy, křoviny a další místa. K takovým biotopům řadíme např. biotop Radotín, Jince, Rozkoš, Dvůr Honětice a další. Rostlinám i živočichům, kteří se na našem území nacházejí, je věnována řada publikací, patří k nim různé encyklopedie nebo atlasy, např. Encyklopedie naší přírody nebo Atlas šumavských rostlin.